组织细胞疾病的分类曾经混乱了很长一段时间，直到1987年组织细胞协会提出了组织细胞疾病的三分类，即Ⅰ类：朗格汉斯细胞组织细胞增生症（Langerhans cell histiocytosis，LCH）；Ⅱ类：非朗格汉斯细胞的单核/吞噬系统的组织细胞病；Ⅲ类：恶性组织细胞病。此分类成为当时的标准分类，但其分类过于简单化，因此，在1997年1月，BE Favara等根据组织细胞疾病的细胞来源及其生物学行为，提出了新分类，即①树突状细胞相关疾病；②单核-巨噬细胞相关疾病；③恶性病（表1-1）。该分类取消了恶性组织细胞病的命名。

1997年11月，WHO召开会议讨论组织细胞和树突细胞肿瘤的分类（表1-2）。该分类仅局限于组织细胞和树突细胞肿瘤，而未将组织细胞的良性疾病纳入其中，并将朗格汉斯细胞组织细胞增生症纳入了树突状细胞肿瘤之列。2008年，WHO血液分会又增加了成纤维细胞性网织细胞肉瘤（fibroblastic reticular cell sarcoma）、播散性幼年性黄色肉芽肿（juvenile xanthogranuloma/disseminated）、未定型细胞肿瘤（interdigitating dendritic cell sarcoma）到该分类中。

近几年随着基因测序等技术的发展，有越来越多的研究发现了组织细胞疾病与基因突变的联系，而以上的分类均未涉及基因突变因素。因此，在2015年的组织细胞学会议上，组织细胞协会综合组织细胞疾病的临床表现、流行病学、病理、免疫表型及基因突变，对组织细胞疾病进行了五分类，即LCMRH分类。其中L组：即朗格汉斯组，包括LCH、未确定的树突状细胞组织细胞增生症（interdigitating dendritic cell histiocytosis，ICH）、Erdheim-Chester病（Erdheim-Chester disease，ECD）、ECD合并LCH；C组：即皮肤和黏膜皮肤组织细胞增生症，包括黄色肉芽肿、非黄色肉芽肿；M组：即恶性组织细胞病组，包括原发性和继发性恶性组织细胞病；R组：即Rosai-Dorfman病（Rosai-Dorfman disease，RDD）组，包括各种类型的RDD；H组：即噬血细胞性淋巴组织细胞增多症（haemophagocytic lymphohistiocytosis，HLH）组，包括原发性HLH和继发性HLH（表1-3）。